Η Φαρμακευτική Βιοτεχνολογία αξιοποιεί τις αρχές και τις μεθοδολογίες της σύγχρονης μοριακής βιολογίας για τον σχεδιασμό, την ανάπτυξη και την παραγωγή βιοφαρμακευτικών προϊόντων με τη χρήση ζωντανών οργανισμών, όπως βακτήρια, ζυμομύκητες και κύτταρα θηλαστικών. Στην Ελλάδα, όπου η φαρμακευτική βιομηχανία αποτελεί έναν σημαντικό τομέα της οικονομίας, η φαρμακευτική βιομηχανία εστιαζόταν μέχρι πρόσφατα αποκλειστικά στην παραγωγή μικρομοριακών φαρμάκων μέσω χημικής σύνθεσης, τα τελευταία όμως, χρόνια το ενδιαφέρον στον τομέα της Φαρμακευτικής Βιοτεχνολογίας αυξάνεται γρήγορα. Στο πλαίσιο αυτό είναι απαραίτητη η εκπαίδευση του ανθρώπινου δυναμικού. Το κενό αυτό έρχεται να καλύψει το Επαγγελματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών «Φαρμακευτική Βιοτεχνολογία» που είναι το μοναδικό που εστιάζει αποκλειστικά στο γνωστικό αυτό αντικείμενο στην Ελλάδα και αναπτύχθηκε μετά από τη συνεργασία του Τμήματος Μοριακής Βιολογίας & Γενετικής με την εταιρεία PHARMATHEN προκειμένου να εκπαιδευτούν στελέχη που ήδη εργάζονται στην εταιρεία, αλλά και νέοι επιστήμονες που επιθυμούν να σταδιοδρομήσουν στον εν λόγω τομέα στην Ελλάδα ή στο εξωτερικό.